83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0704 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  768    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  60.9 
 
 		 723 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.81 
 
 		 1357 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  52.78 
 
 		 682 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  58.73 
 
 		 1176 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  57.48 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  54.76 
 
 		 635 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  57.14 
 
 		 632 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  50 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  51.24 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  51.59 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  38.2 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.11 
 
 		 554 aa  86.7  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.74 
 
 		 547 aa  86.3  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  29.03 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.8 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.61 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.64 
 
 		 673 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  31.63 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.18 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  32.37 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  32.93 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  31.38 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  37.29 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  37.41 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  30.51 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  28.4 
 
 		 275 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.88 
 
 		 734 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  31.84 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.86 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  37.01 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.58 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  31.05 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  27.84 
 
 		 207 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  39.67 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  27.84 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  27.84 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  27.84 
 
 		 192 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  27.84 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  35.9 
 
 		 1115 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  27.91 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  27.91 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  27.91 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.15 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  28.16 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  28.16 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  36.59 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  29.53 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  30.08 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  29.35 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  26.7 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  30.19 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  33.67 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  35.71 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  34.29 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  32.26 
 
 		 272 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  33.68 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  31.58 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.83 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  33.71 
 
 		 321 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  25.98 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  32.26 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  34.83 
 
 		 258 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  29.41 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  31.2 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  32.63 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  30.68 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  31.82 
 
 		 284 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  30.83 
 
 		 320 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  25.97 
 
 		 280 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>