219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0399 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
166 aa  319  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  52.41 
 
 
173 aa  166  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  53.66 
 
 
174 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  52.15 
 
 
175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  52.15 
 
 
175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  51.53 
 
 
175 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  50.66 
 
 
165 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  45.96 
 
 
171 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  48.37 
 
 
226 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  47.37 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  46.41 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  50.66 
 
 
160 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  44.44 
 
 
166 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  39.87 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  36.18 
 
 
185 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  32.26 
 
 
180 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  51.82 
 
 
121 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  33.55 
 
 
179 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  34.59 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  34.01 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  30.22 
 
 
242 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  30.08 
 
 
227 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  31.08 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  33.12 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 
248 aa  80.9  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  34.59 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  30.94 
 
 
258 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  27.89 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  30.3 
 
 
289 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  30.53 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  31.16 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  30.26 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  26.43 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  27.86 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  27.61 
 
 
289 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  31.39 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.14 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  28 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  27.14 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  27.14 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  32.58 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  30.82 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  29.66 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.61 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  26.71 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  26.43 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  26.43 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  27.01 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  26.43 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  28.08 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  26.72 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  25.93 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  28.12 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  28.19 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  29.29 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  25.55 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.47 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  29.41 
 
 
234 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  25.55 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  27.69 
 
 
289 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  27.4 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  27.63 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  36.73 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  28.48 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  28.47 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  28.48 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 
236 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  26.12 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.81 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  31.34 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  26.87 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  25.69 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  26.15 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.47 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  29.84 
 
 
236 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.81 
 
 
226 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  23.29 
 
 
241 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  27.69 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  26.87 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  25.5 
 
 
286 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  28.47 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  26.39 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  26.67 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  24.48 
 
 
286 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  25.74 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  25 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  22.07 
 
 
237 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>