More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0954 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0954  putative phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
271 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  39.39 
 
 
269 aa  158  7e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 
268 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.66 
 
 
260 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  37.86 
 
 
288 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  39.21 
 
 
268 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.21 
 
 
268 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 
264 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  39.41 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  39.57 
 
 
497 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 
264 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  39.11 
 
 
257 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  38.14 
 
 
262 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 
264 aa  142  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  39.58 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
288 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
288 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  36.89 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  37.04 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  34.73 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  34.69 
 
 
265 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  38.6 
 
 
490 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  38.05 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  38.05 
 
 
269 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  37.28 
 
 
269 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  36.84 
 
 
510 aa  135  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  37.07 
 
 
285 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  35.11 
 
 
280 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  34.03 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  37.67 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  36.28 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  36.4 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.13 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  35.59 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  36.87 
 
 
283 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
484 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  38.62 
 
 
273 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  40.55 
 
 
264 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
303 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 
267 aa  132  5e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.51 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 
449 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  35.32 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  35.71 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  38.16 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  36.82 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  35.32 
 
 
436 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  31.75 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  36.89 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 
497 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  32.14 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  36.75 
 
 
270 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 
271 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  37.62 
 
 
484 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 
253 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  33.93 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  33.19 
 
 
432 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  33.76 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  36.8 
 
 
301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  35.68 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  37.3 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  36.56 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  36.77 
 
 
270 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
273 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  35.32 
 
 
268 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  31.69 
 
 
275 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  35.24 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  34.56 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  34.02 
 
 
252 aa  125  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 
450 aa  125  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  35.87 
 
 
270 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.67 
 
 
273 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  35.87 
 
 
270 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  32.93 
 
 
270 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  34.57 
 
 
266 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
268 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  32.63 
 
 
270 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0362  phosphomethylpyrimidine kinase  36.74 
 
 
259 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 
444 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  35.68 
 
 
259 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  35.04 
 
 
291 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
268 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>