More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_15361 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  96.8 
 
 		 438 aa  847    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 440 aa  870    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  67.73 
 
 		 438 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  65.22 
 
 		 438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  64.29 
 
 		 435 aa  541  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  63.33 
 
 		 435 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  55.94 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  55.48 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  55.48 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  54.79 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  56.21 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  54.02 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  54.02 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  52.63 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  50.89 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  51.04 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  50.8 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  51.15 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.62 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.82 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 		 438 aa  326  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 431 aa  322  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.2 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 436 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.65 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  39 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 428 aa  302  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.01 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 431 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 		 449 aa  296  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  39.55 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  38.9 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  39.54 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  38.04 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  39.55 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 		 438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 453 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  38.83 
 
 		 441 aa  288  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  41.08 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  38.62 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  41.36 
 
 		 427 aa  286  7e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>