106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4072 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  322  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  73.17 
 
 		 162 aa  234  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  77.87 
 
 		 168 aa  191  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  69.53 
 
 		 168 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  69.53 
 
 		 168 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  69.53 
 
 		 168 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  48.28 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  49.55 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  36.26 
 
 		 179 aa  95.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.91 
 
 		 118 aa  84  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  35.33 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  38.53 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  32.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  38.71 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  32.46 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  39.45 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  38.64 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  30.7 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  30.7 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  30.7 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  31.9 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  35.34 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  31.03 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  41.49 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  32.76 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  29.31 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  31.03 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  30.17 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  31.9 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  31.19 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  31.03 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  30.33 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  31.19 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  30.7 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  32.11 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  32.28 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  31.19 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  29.57 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  35.05 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  30.28 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  30.84 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  33.08 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  25.86 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 188 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  29.79 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  29 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  29 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  40 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  31.31 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  30.85 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  38.27 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  29.79 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  30.28 
 
 		 233 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  29.79 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  29.85 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  28.91 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  29.07 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  26.6 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  30 
 
 		 301 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  26 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  32.39 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  28.89 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  25.49 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  24.51 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  27.84 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>