More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1094 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  590  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  98.95 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  92.28 
 
 
285 aa  551  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  87.64 
 
 
275 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  87.64 
 
 
275 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 
273 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 
273 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 
273 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  75.96 
 
 
287 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  75.96 
 
 
287 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  74.14 
 
 
295 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  70.51 
 
 
299 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  65.6 
 
 
288 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  63.86 
 
 
288 aa  358  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  63.67 
 
 
290 aa  357  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  69.93 
 
 
286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  63.31 
 
 
290 aa  355  5e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  63.31 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  59.57 
 
 
288 aa  345  4e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  76.47 
 
 
221 aa  328  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  59.93 
 
 
273 aa  311  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  59.93 
 
 
273 aa  311  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  59.55 
 
 
273 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
293 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
293 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
293 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
293 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
293 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
293 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
293 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  88.51 
 
 
154 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  52.11 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  92.13 
 
 
127 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  41.96 
 
 
291 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  77.1 
 
 
131 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  73.13 
 
 
306 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  39.93 
 
 
281 aa  178  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
271 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
271 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
271 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  36.19 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  36.19 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35.84 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35.84 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35.84 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35.84 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35.84 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.8 
 
 
286 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.93 
 
 
286 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.93 
 
 
286 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.93 
 
 
286 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.93 
 
 
286 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  35.27 
 
 
281 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  37 
 
 
293 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  37 
 
 
293 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  37 
 
 
293 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  38.49 
 
 
283 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  38.49 
 
 
283 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  34.32 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  35.82 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  35.82 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  36.94 
 
 
277 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  36.13 
 
 
292 aa  149  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  36.62 
 
 
291 aa  148  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  36.62 
 
 
291 aa  148  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  33.33 
 
 
291 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  33.33 
 
 
291 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  33.33 
 
 
291 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  37.69 
 
 
283 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  35.45 
 
 
286 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  33.21 
 
 
393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  42.19 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  33.21 
 
 
390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  33.21 
 
 
390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  33.21 
 
 
390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  34.59 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  34.59 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  34.59 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  43.5 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.39 
 
 
200 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  36.19 
 
 
286 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  35.47 
 
 
272 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  33.21 
 
 
288 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  33.81 
 
 
279 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.389747 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  33.21 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  33.21 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  33.21 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  33.21 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  33.21 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>