More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0604 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  100 
 
 
127 aa  256  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  92.91 
 
 
285 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  92.13 
 
 
285 aa  236  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  89.76 
 
 
285 aa  234  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  88.98 
 
 
275 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  88.98 
 
 
275 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  82.68 
 
 
273 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  82.68 
 
 
273 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  82.68 
 
 
273 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  77.86 
 
 
131 aa  210  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  77.17 
 
 
287 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  77.17 
 
 
287 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  75.57 
 
 
295 aa  201  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  78.7 
 
 
221 aa  175  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  66.94 
 
 
288 aa  168  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  73.02 
 
 
288 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  65.29 
 
 
273 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  65.29 
 
 
273 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  65.29 
 
 
273 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  66.67 
 
 
290 aa  157  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  66.67 
 
 
290 aa  157  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  66.67 
 
 
290 aa  157  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  70.87 
 
 
286 aa  156  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  67.72 
 
 
288 aa  154  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  70.08 
 
 
299 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  59.84 
 
 
293 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  59.84 
 
 
293 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  59.84 
 
 
293 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  59.84 
 
 
293 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  59.84 
 
 
293 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  59.84 
 
 
293 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  59.84 
 
 
293 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  58.87 
 
 
293 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  44.44 
 
 
291 aa  106  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  43.8 
 
 
271 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  43.8 
 
 
271 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  43.8 
 
 
271 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  44.07 
 
 
281 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  42.24 
 
 
286 aa  94  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  43.1 
 
 
286 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  39.66 
 
 
294 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  42.24 
 
 
280 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  42.24 
 
 
280 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  41.38 
 
 
283 aa  90.5  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  40.35 
 
 
259 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2722  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  40.52 
 
 
285 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 
271 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
270 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
270 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
270 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
270 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
270 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  39.83 
 
 
281 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 
271 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
270 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
270 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  39.66 
 
 
286 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
285 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.52 
 
 
286 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  41.67 
 
 
279 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  41.67 
 
 
279 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  41.67 
 
 
279 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.52 
 
 
292 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.52 
 
 
286 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.52 
 
 
286 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.52 
 
 
286 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.52 
 
 
286 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  37.8 
 
 
279 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  37.07 
 
 
294 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  37.07 
 
 
294 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  37.07 
 
 
294 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  37.07 
 
 
294 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  37.07 
 
 
294 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  39.66 
 
 
289 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.66 
 
 
285 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.24 
 
 
288 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  37.19 
 
 
275 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  37.19 
 
 
275 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>