More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1438 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  70.51 
 
 		 285 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  71.19 
 
 		 285 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  67.99 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  70.51 
 
 		 285 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  69.82 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  69.82 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  66.55 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  66.55 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  67.12 
 
 		 286 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  61.2 
 
 		 288 aa  332  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  57.67 
 
 		 290 aa  322  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  58 
 
 		 290 aa  322  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  58 
 
 		 290 aa  322  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  55.67 
 
 		 288 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  68.26 
 
 		 221 aa  299  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  52.11 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  66.67 
 
 		 154 aa  218  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  41.45 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  67.94 
 
 		 131 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  70.08 
 
 		 127 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  38.3 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  37.28 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  37.28 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  37.28 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  57.23 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  36.3 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.16 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.29 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.29 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.29 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.29 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  32.86 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  32.86 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  34.89 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  34.89 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  34.89 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  44.72 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  35.79 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  35.79 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  35.79 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  35.79 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  35.79 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  35.55 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  35.97 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  35.97 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  35.97 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.31 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  45.34 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  33.58 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  34.06 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 208 aa  136  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>