More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4506 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  100 
 
 
288 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  75.35 
 
 
288 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  67.84 
 
 
290 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  64.56 
 
 
285 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  67.14 
 
 
290 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  63.86 
 
 
285 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  67.14 
 
 
290 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  63.86 
 
 
285 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  64.73 
 
 
275 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  64.73 
 
 
275 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 
273 aa  361  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 
273 aa  361  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 
273 aa  361  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  62.63 
 
 
295 aa  360  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  61.43 
 
 
288 aa  357  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  66.67 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  66.67 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  66.3 
 
 
273 aa  355  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  62.59 
 
 
287 aa  346  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  62.59 
 
 
287 aa  346  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  58.45 
 
 
293 aa  334  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  58.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  58.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  58.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  58.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  58.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  58.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  58.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  61.2 
 
 
299 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  62.81 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  66.06 
 
 
221 aa  272  6e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  45.99 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  60.67 
 
 
154 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  44.03 
 
 
281 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  38.66 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  38.66 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  41.91 
 
 
271 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  41.91 
 
 
271 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  41.91 
 
 
271 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  38.18 
 
 
286 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  38.18 
 
 
286 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  38.18 
 
 
286 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  38.18 
 
 
286 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  38.18 
 
 
286 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  38.87 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  37.99 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  38.87 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  38.87 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  36.49 
 
 
294 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  38.29 
 
 
291 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  38.29 
 
 
291 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  38.29 
 
 
291 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  36.73 
 
 
290 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  39.46 
 
 
271 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  38.11 
 
 
293 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  38.11 
 
 
293 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  38.11 
 
 
293 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  66.15 
 
 
131 aa  168  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  35.21 
 
 
280 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
289 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
289 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
280 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  37.12 
 
 
275 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  35.21 
 
 
280 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  35.21 
 
 
280 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.94 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.94 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.94 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.94 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.94 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  36.63 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  36.63 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  39.03 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  33.92 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  33.92 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  33.92 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  38.06 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  33.92 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  35.4 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  37.74 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  67.72 
 
 
127 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>