More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2849 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  99.63 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 288 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  66.92 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  63.3 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  65.2 
 
 		 290 aa  347  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  64.84 
 
 		 290 aa  344  8.999999999999999e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  64.1 
 
 		 290 aa  340  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  60.67 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  60.67 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  60.67 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  60.3 
 
 		 285 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  60.67 
 
 		 275 aa  334  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  60.67 
 
 		 275 aa  334  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  58.8 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  59.93 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  59.71 
 
 		 295 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  53.36 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  53 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  56.51 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  56.51 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  59.06 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  55.44 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  59.73 
 
 		 221 aa  253  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  43.64 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  41.09 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  41.09 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  41.09 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  54.36 
 
 		 154 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  40.07 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  38.69 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  38.69 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  38.69 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  38.69 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  38.69 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  34.19 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  34.19 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  36.86 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  65.29 
 
 		 127 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  63.49 
 
 		 131 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  37.31 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  37.31 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  37.31 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  37.31 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  36.19 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  35.82 
 
 		 286 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  35.82 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  35.82 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  34.7 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  34.7 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  34.7 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  35.82 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  35.9 
 
 		 281 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>