More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0628 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  89.76 
 
 		 293 aa  552  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  58.8 
 
 		 288 aa  318  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  58.1 
 
 		 288 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  54.01 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  54.36 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  53.02 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  53 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  53 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  53.66 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 273 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  52.96 
 
 		 290 aa  285  5e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  52.65 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  52.65 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  52.65 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  52.98 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  52.98 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  52.61 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  51.92 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  55.91 
 
 		 286 aa  271  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  50.52 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  53 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  51.52 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  41.26 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  38.41 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  38.41 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  38.41 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  37.68 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  38.41 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  38.41 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  37.68 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  37.68 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  35.23 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  35.23 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  35.23 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  34.16 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  38.21 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  38.21 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  38.21 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  38.21 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  38.21 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  36.96 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  35.84 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  35.84 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  35.84 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  34.28 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  34.4 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  35.9 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  35.46 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  59.52 
 
 		 131 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  35.46 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  35.46 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  36.59 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  36.59 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  35.19 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  59.84 
 
 		 127 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  34.52 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  34.52 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  36.09 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  35.56 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  35.56 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  35.56 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  34.07 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  46.25 
 
 		 154 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  33.46 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  33.46 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  33.46 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  33.46 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>