More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5990 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  90.91 
 
 		 285 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  87.91 
 
 		 273 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  87.91 
 
 		 273 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  87.91 
 
 		 273 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 285 aa  500  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  87.64 
 
 		 285 aa  494  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  74.29 
 
 		 295 aa  424  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  75.81 
 
 		 287 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  75.81 
 
 		 287 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  64.73 
 
 		 288 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  62.69 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  64.23 
 
 		 288 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  62.31 
 
 		 290 aa  348  7e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  62.31 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  69.93 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  77.83 
 
 		 221 aa  338  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  59.19 
 
 		 288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  60.67 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  60.67 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  60.3 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  53.19 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  89.19 
 
 		 154 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  52.98 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  52.98 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  52.98 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  52.98 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  52.98 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  52.98 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  52.98 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  88.98 
 
 		 127 aa  228  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  77.86 
 
 		 131 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  38.77 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  39.55 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  72 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  34.7 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  34.7 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.48 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.61 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.61 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.61 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.61 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  35.32 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  34.33 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  34.33 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  34.33 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  34.33 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  34.33 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  35.34 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  35.34 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  35.34 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  35.61 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  35.61 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  35.61 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  35.45 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  35.23 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  35.61 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  34.46 
 
 		 393 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  34.46 
 
 		 390 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  34.46 
 
 		 390 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  34.46 
 
 		 390 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  35.09 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  35.09 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  36.5 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  36.5 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  35.09 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  42.39 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  34.57 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  45.24 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  36.09 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  36.6 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  33.84 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  34.07 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  34.96 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.85 
 
 		 200 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  34.2 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>