More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3645 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  71.68 
 
 
285 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  70.98 
 
 
285 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  70.28 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  70.29 
 
 
275 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  70.29 
 
 
275 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  68.75 
 
 
295 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  68.64 
 
 
287 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  68.64 
 
 
287 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  68.61 
 
 
273 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  68.61 
 
 
273 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  68.61 
 
 
273 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  67.12 
 
 
299 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  64.98 
 
 
290 aa  352  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  64.62 
 
 
290 aa  350  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  64.62 
 
 
290 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  63.16 
 
 
288 aa  346  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  59.51 
 
 
288 aa  342  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  62.68 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  72.85 
 
 
221 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  55.79 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  56.99 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  56.99 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  56.99 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  56.99 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  56.99 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  56.99 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  56.99 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  59.7 
 
 
273 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  59.7 
 
 
273 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  59.33 
 
 
273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  44.6 
 
 
291 aa  219  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  68.46 
 
 
154 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  41.97 
 
 
271 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  41.97 
 
 
271 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  41.97 
 
 
271 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  70.87 
 
 
127 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  39.55 
 
 
281 aa  175  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  67.18 
 
 
131 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  36.94 
 
 
291 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  36.94 
 
 
291 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  36.94 
 
 
291 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  34.86 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  65.15 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  33.46 
 
 
270 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  33.46 
 
 
270 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  33.08 
 
 
270 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  33.08 
 
 
270 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  33.08 
 
 
270 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  33.08 
 
 
270 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  33.08 
 
 
270 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  33.96 
 
 
293 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  33.96 
 
 
293 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  33.96 
 
 
293 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  34.6 
 
 
269 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  33.84 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  35.42 
 
 
286 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  33.94 
 
 
286 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.07 
 
 
286 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.07 
 
 
286 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.07 
 
 
286 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.07 
 
 
286 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  36.23 
 
 
272 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  35.9 
 
 
292 aa  149  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  36.36 
 
 
275 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 
274 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  34.07 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  33.81 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  33.81 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  34.07 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  36.76 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  32.37 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  36.76 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  36.76 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  36.76 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  35.19 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  36.76 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  33.6 
 
 
270 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>