More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3211 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  75.35 
 
 
288 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  66.31 
 
 
285 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  65.6 
 
 
285 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  65.6 
 
 
285 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  64.66 
 
 
290 aa  360  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  64.23 
 
 
275 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  64.23 
 
 
275 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  61.9 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  63.96 
 
 
290 aa  356  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  66.92 
 
 
273 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  60.93 
 
 
288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  66.92 
 
 
273 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 
273 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 
273 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 
273 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  63.96 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  66.54 
 
 
273 aa  353  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  60.56 
 
 
293 aa  346  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
293 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
293 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
293 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
293 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
293 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
293 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
293 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  59.86 
 
 
287 aa  328  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  59.86 
 
 
287 aa  328  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  61.11 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  62.32 
 
 
286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  66.67 
 
 
221 aa  275  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  43.55 
 
 
291 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 
271 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 
271 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 
271 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  39.54 
 
 
270 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  39.54 
 
 
270 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  39.54 
 
 
270 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  39.54 
 
 
270 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  39.54 
 
 
270 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  58 
 
 
154 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  40.74 
 
 
281 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  38.02 
 
 
270 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  38.02 
 
 
270 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  40.15 
 
 
289 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  40.15 
 
 
280 aa  178  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  40.15 
 
 
289 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  73.02 
 
 
127 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  67.69 
 
 
131 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  38.18 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  39.03 
 
 
291 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  39.03 
 
 
291 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  39.03 
 
 
291 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 
383 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  38.43 
 
 
293 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  38.43 
 
 
293 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  38.43 
 
 
293 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  37.31 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  37.31 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  37.55 
 
 
286 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  38.49 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  37.17 
 
 
286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  38.4 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  38.31 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>