More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3240 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 273 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 273 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 273 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  87.91 
 
 		 275 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  87.91 
 
 		 275 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  86.08 
 
 		 285 aa  494  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  86.08 
 
 		 285 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 285 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  74.1 
 
 		 295 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  73.82 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  73.82 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  69.64 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  63.16 
 
 		 290 aa  351  5.9999999999999994e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  63.6 
 
 		 288 aa  351  8.999999999999999e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  63.5 
 
 		 290 aa  349  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  63.5 
 
 		 290 aa  349  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 		 288 aa  344  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  77.38 
 
 		 221 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  68.25 
 
 		 286 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  58.15 
 
 		 288 aa  333  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  60.67 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  60.67 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  60.3 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  52.65 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  88.51 
 
 		 154 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  52.35 
 
 		 293 aa  278  9e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  82.68 
 
 		 127 aa  214  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  80.92 
 
 		 131 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  37.96 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  38.78 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 270 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 270 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 270 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 270 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 270 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  66.67 
 
 		 306 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  35.61 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  33.96 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  33.96 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  33.96 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.59 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.72 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.72 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.72 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.72 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 393 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 390 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 390 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 390 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  37.12 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  37.12 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  33.84 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  33.85 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  33.85 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  38.18 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  35.96 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  36.06 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  36.06 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  36.06 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  42.51 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  36.06 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  35.32 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.76 
 
 		 200 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  42.61 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  33.71 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>