228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0648 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  94.81 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  94.81 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  74.63 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  72.59 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  73.88 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  71.01 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  72.8 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  72.8 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  70.49 
 
 		 154 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  58.49 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  67.48 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  67.48 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  67.48 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  55.56 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  54.81 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  54.81 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  54.81 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  51.85 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  70.79 
 
 		 221 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1664  hypothetical protein  78.48 
 
 		 159 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  49.17 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  49.17 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  49.17 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  41.04 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  40.74 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  71.43 
 
 		 48 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  34.11 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  29.13 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  29.66 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  28.68 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  28.79 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  24.88 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  29.91 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  28.68 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  28.68 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  27.22 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  29.06 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 232 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  27.54 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  28.17 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  26.5 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  26.5 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  29.1 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  29.1 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.13 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.13 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  31.01 
 
 		 427 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.13 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.13 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.13 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  32.47 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  27.85 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  31.45 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  31.45 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  29.92 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  26.87 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  29.92 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  27.33 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  27.54 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  27.54 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  27.54 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  33.33 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  33.33 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  29.5 
 
 		 522 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  29.92 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  26.6 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  26.74 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  26.74 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  26.74 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>