35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10250 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  100 
 
 
48 aa  97.1  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  81.4 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  84.21 
 
 
285 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  84.21 
 
 
285 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  78.95 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  75.61 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  71.43 
 
 
306 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  81.08 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  67.44 
 
 
290 aa  63.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1664  hypothetical protein  75 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  77.78 
 
 
287 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  77.78 
 
 
287 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  65.12 
 
 
290 aa  62  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  65.12 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  61.9 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
288 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  78.57 
 
 
275 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  78.57 
 
 
275 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  54.05 
 
 
288 aa  50.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  73.08 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  73.08 
 
 
273 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  73.08 
 
 
273 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  73.08 
 
 
273 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  55.17 
 
 
293 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>