More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1278 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1278  Na+/solute symporter  100 
 
 		 473 aa  923    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000360509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.34 
 
 		 504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  28.15 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.95 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  28.05 
 
 		 489 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.59 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  27.59 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.59 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  27.63 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  26.34 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  28.87 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  27.72 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  28.87 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  28.64 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  28.64 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  28.64 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  28.64 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  28.64 
 
 		 477 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  28.4 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.5 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  28.4 
 
 		 477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  27.77 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  28.01 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 		 483 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  24.81 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.87 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  28.43 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  28.37 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  28.37 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  28.37 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  28.37 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  28.37 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  28.37 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  28.37 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.54 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.42 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  27.54 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  27.54 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.54 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  27.54 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 		 512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  23.75 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  25.75 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  25.75 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  25.39 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  26.54 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  23.16 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  23.27 
 
 		 553 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  25 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.6 
 
 		 489 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.22 
 
 		 527 aa  97.1  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  24.33 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.74 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  24.71 
 
 		 494 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26.98 
 
 		 483 aa  94.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.65 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  23.45 
 
 		 495 aa  93.2  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.33 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  23.36 
 
 		 524 aa  91.3  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  23.53 
 
 		 489 aa  91.3  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  26.98 
 
 		 495 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  24.06 
 
 		 527 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.8 
 
 		 483 aa  90.5  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.58 
 
 		 533 aa  90.1  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.52 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  27.47 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.18 
 
 		 533 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.51 
 
 		 483 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 459 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.96 
 
 		 533 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  23.51 
 
 		 536 aa  86.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.45 
 
 		 503 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.9 
 
 		 483 aa  86.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  23.71 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  23.71 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  24.88 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  26.29 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  27.98 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  24.73 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.54 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  24.26 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  25.16 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  22.51 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.07 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.85 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  26.54 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  25.45 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 638 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.75 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.03 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>