241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3106 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3106  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 978 aa  1977    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  28.63 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  23.77 
 
 		 961 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  23.61 
 
 		 971 aa  116  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1033 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  40.96 
 
 		 222 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.6 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.04 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.59 
 
 		 381 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1478  pentapeptide repeat-containing protein  24.89 
 
 		 263 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  45.59 
 
 		 497 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  39.32 
 
 		 234 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.61 
 
 		 521 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 903 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 180 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  39.32 
 
 		 234 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  33.08 
 
 		 291 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 184 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  33.08 
 
 		 291 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.96 
 
 		 745 aa  55.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  35.07 
 
 		 614 aa  55.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 320 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  38.64 
 
 		 267 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 241 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  42.55 
 
 		 433 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.65 
 
 		 408 aa  55.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 416 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 		 256 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.19 
 
 		 311 aa  55.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  37.21 
 
 		 181 aa  54.7  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  27.82 
 
 		 172 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 182 aa  54.7  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  36.19 
 
 		 260 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 168 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  32.17 
 
 		 213 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37 
 
 		 216 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.08 
 
 		 441 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 		 190 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  26.18 
 
 		 973 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 438 aa  53.5  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 		 255 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 245 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 		 149 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 151 aa  53.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 		 149 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.4 
 
 		 449 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  34.07 
 
 		 264 aa  52.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 		 179 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.66 
 
 		 343 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.66 
 
 		 343 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 		 384 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  36.97 
 
 		 182 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.06 
 
 		 447 aa  52  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 174 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 		 327 aa  52  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 483 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.97 
 
 		 268 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 294 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  36.46 
 
 		 872 aa  51.6  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 		 493 aa  52  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 825 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 862 aa  51.2  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  44.62 
 
 		 259 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 		 176 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 		 776 aa  51.6  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  39.73 
 
 		 357 aa  51.6  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 825 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 825 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 825 aa  51.6  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 825 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 		 176 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.87 
 
 		 214 aa  51.2  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  37.78 
 
 		 168 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 524 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  50.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  38.37 
 
 		 288 aa  51.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 351 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 		 204 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.17 
 
 		 312 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 		 145 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 		 145 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2569  pentapeptide repeat protein  31.5 
 
 		 160 aa  50.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 215 aa  50.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 		 727 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 		 167 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 277 aa  50.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  34.11 
 
 		 233 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  50.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  39.18 
 
 		 142 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4358  pentapeptide repeat protein  37.61 
 
 		 152 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 517 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.86 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  40.74 
 
 		 1807 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.17 
 
 		 493 aa  50.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 		 825 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>