173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1520 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1520  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 266 aa  536  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2417  hypothetical protein  38.49 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0754  hypothetical protein  39.15 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0886738  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0594  hypothetical protein  39.15 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0704  hypothetical protein  39.15 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2108  hypothetical protein  39.15 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1659  hypothetical protein  39.15 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0880  hypothetical protein  39.62 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0521  hypothetical protein  38.68 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2013  hypothetical protein  38.68 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0741124  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03039  signal peptide protein  37.8 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4016  protein of unknown function DUF323  35.12 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4129  protein of unknown function DUF323  35.12 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  29.71 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 861 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0887  protein of unknown function DUF323  30.16 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0172  hypothetical protein  32.67 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  30.17 
 
 		 952 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  31.68 
 
 		 922 aa  59.3  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  27.76 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  28.1 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  32.06 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  27.23 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  24.36 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  36.96 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  25.68 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  24.68 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  25.57 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.57 
 
 		 437 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  24.83 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  25.09 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  23.08 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  26.44 
 
 		 287 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  26.18 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  29.71 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  29.71 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  22.44 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  29.71 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  21.98 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.02 
 
 		 506 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  23.81 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  26.74 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 		 432 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0576  hypothetical protein  26.78 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  31.68 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 		 432 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  23.79 
 
 		 417 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  26.63 
 
 		 327 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  28.74 
 
 		 1049 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  24.7 
 
 		 390 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  31.19 
 
 		 819 aa  49.7  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  30 
 
 		 424 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  25.86 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  23.64 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.65 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  26.47 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  26.35 
 
 		 329 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  29.81 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  27.62 
 
 		 325 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 		 447 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  24.39 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 668 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  31.15 
 
 		 414 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  28.3 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  28.57 
 
 		 633 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  28.4 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  32.65 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  25.16 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  27.47 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  28.88 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  25.64 
 
 		 351 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  24.78 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  31.15 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  25.88 
 
 		 439 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  33.93 
 
 		 444 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  27.55 
 
 		 468 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  24.56 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.95 
 
 		 446 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.32 
 
 		 444 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  28.98 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  24.32 
 
 		 361 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  29.79 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  29.33 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  26.27 
 
 		 341 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  32.17 
 
 		 421 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  32.17 
 
 		 377 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  28.51 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>