More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04702 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  100 
 
 		 319 aa  670    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  82.24 
 
 		 320 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05513  Sulfatase modifying factor 1 precursor-like protein (C-alpha-formyglycine-generating enzyme 1)  82.24 
 
 		 320 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  86.47 
 
 		 282 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  31.51 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  32.61 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1793  hypothetical protein  31.12 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  26.03 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.73 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.23 
 
 		 398 aa  92.4  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.08 
 
 		 267 aa  89  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  31 
 
 		 276 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.59 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  31.63 
 
 		 346 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  28.21 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  27.69 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 925 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  27 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  28.88 
 
 		 586 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  26.69 
 
 		 952 aa  82.8  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.73 
 
 		 820 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 		 715 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.83 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  29.02 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  24.01 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  26.57 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 637 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  25.36 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  25.29 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  27.72 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  29.11 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25.1 
 
 		 829 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.09 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.09 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  26.6 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1911 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  29.28 
 
 		 802 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  28.96 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  28.04 
 
 		 740 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  24.21 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.64 
 
 		 657 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 		 751 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  29.17 
 
 		 781 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  29.67 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  28.04 
 
 		 668 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  26.62 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  27.56 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  26.72 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  28.57 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  25.66 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  26.75 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  27.21 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  27.08 
 
 		 742 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 623 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  28.08 
 
 		 862 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.2 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  28.78 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  29.65 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  29.41 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  24.42 
 
 		 636 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  31.55 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  27.44 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  30.46 
 
 		 929 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  26.77 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  28.91 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  27.61 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  37.12 
 
 		 922 aa  72.8  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  27.62 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  26.4 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  27.48 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  26.84 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  26.18 
 
 		 421 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  26.45 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 637 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  26.29 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  27.13 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  27.49 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 		 523 aa  69.7  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 		 625 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  27.04 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  36.84 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  26.79 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.35 
 
 		 826 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 617 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>