More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04718 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  100 
 
 
282 aa  589  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  95.56 
 
 
320 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05513  Sulfatase modifying factor 1 precursor-like protein (C-alpha-formyglycine-generating enzyme 1)  90.37 
 
 
320 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  86.35 
 
 
319 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  32.04 
 
 
330 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  32.21 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1793  hypothetical protein  30.43 
 
 
354 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.92 
 
 
398 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  27.74 
 
 
325 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.1 
 
 
398 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.84 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.32 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  32.41 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  26.67 
 
 
319 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.47 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.53 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  29.79 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.56 
 
 
346 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  28.27 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  27.59 
 
 
586 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  26.59 
 
 
517 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.77 
 
 
751 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  27.97 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 
925 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
715 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.89 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  28.79 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  26.94 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  24.68 
 
 
433 aa  82.4  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  26.3 
 
 
829 aa  82.4  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  29.52 
 
 
1911 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
1818 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  28.74 
 
 
742 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.28 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.05 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  25.97 
 
 
826 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  25.93 
 
 
636 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  30.8 
 
 
358 aa  79  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  34.56 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  29.12 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.65 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  30.8 
 
 
781 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  29.17 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  29.67 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.69 
 
 
616 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  27.39 
 
 
586 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  29.59 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.4 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
637 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  28.31 
 
 
538 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  38.97 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  26.25 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  24.89 
 
 
551 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  27.57 
 
 
668 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  27.98 
 
 
952 aa  75.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  29.95 
 
 
603 aa  75.5  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  27.19 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.37 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  24.7 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  26.56 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  31.63 
 
 
570 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  24.05 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.81 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  28.64 
 
 
862 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  27.54 
 
 
740 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  26.37 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.49 
 
 
654 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  24.77 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  26.37 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  28.29 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  28.29 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  28.37 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.03 
 
 
820 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  29.19 
 
 
929 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  30.09 
 
 
527 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  27.83 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  27.4 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  29.47 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  26.27 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 
1132 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
637 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
593 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.33 
 
 
416 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  25.72 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
620 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.31 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  26.6 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  26.75 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.77 
 
 
657 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
623 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
621 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  37.4 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>