244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1793 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1793  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  740    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  68.08 
 
 
355 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  38.95 
 
 
330 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  32.7 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  29.94 
 
 
319 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  28.95 
 
 
320 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05513  Sulfatase modifying factor 1 precursor-like protein (C-alpha-formyglycine-generating enzyme 1)  28.24 
 
 
320 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  31.48 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.21 
 
 
279 aa  96.3  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  29.02 
 
 
293 aa  89.7  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  28.05 
 
 
276 aa  89.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.5 
 
 
829 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  25.62 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  27.69 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.57 
 
 
586 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  25.44 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  26.02 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 
433 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  36.84 
 
 
826 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  27.34 
 
 
742 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.09 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  36.76 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  26.62 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  26.32 
 
 
751 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  29.93 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 
668 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  23.16 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  22.61 
 
 
611 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  36.43 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  32.02 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  29.1 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  22.09 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  32.85 
 
 
922 aa  69.7  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  30.56 
 
 
952 aa  69.3  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.47 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.47 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.59 
 
 
657 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  30.67 
 
 
1581 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.2 
 
 
517 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  25.4 
 
 
446 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  25.37 
 
 
614 aa  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.59 
 
 
654 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  33.8 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  28.05 
 
 
289 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  34.33 
 
 
201 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  25.99 
 
 
527 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
637 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  26.45 
 
 
413 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  26.3 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  26.58 
 
 
538 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  27.71 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.14 
 
 
616 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  28.74 
 
 
277 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  30.72 
 
 
370 aa  62.8  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  25.91 
 
 
551 aa  62.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  24.48 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
308 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
623 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  35.16 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  27.85 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  28.76 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
1818 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
617 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  26.54 
 
 
740 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  29.33 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  26.76 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
349 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  27.75 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 
715 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  25 
 
 
1196 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  29.85 
 
 
298 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  26.01 
 
 
1911 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  34.71 
 
 
772 aa  59.3  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  30.88 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  32.23 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  24.3 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  26.32 
 
 
453 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
639 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
639 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  24.79 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  25.74 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  26.92 
 
 
586 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
637 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.96 
 
 
925 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.07 
 
 
892 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  26.81 
 
 
491 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  26.43 
 
 
522 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  31.45 
 
 
262 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.56 
 
 
475 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  34.35 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
618 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  29.71 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
620 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  28.47 
 
 
351 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  34.88 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>