More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04714 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  100 
 
 
320 aa  672    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05513  Sulfatase modifying factor 1 precursor-like protein (C-alpha-formyglycine-generating enzyme 1)  95.62 
 
 
320 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  82.24 
 
 
319 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  95.85 
 
 
282 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  31.85 
 
 
330 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  29.54 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1793  hypothetical protein  28.95 
 
 
354 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  27.76 
 
 
325 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.1 
 
 
398 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  28.85 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.08 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.9 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  28.96 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  31.27 
 
 
276 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 
1818 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  26.88 
 
 
398 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 
288 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.13 
 
 
291 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  26.91 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.22 
 
 
614 aa  87.8  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.5 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
715 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  24.82 
 
 
517 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
308 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.21 
 
 
751 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  28.9 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  25.17 
 
 
433 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.54 
 
 
517 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  32.57 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 
303 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  26.57 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  27.76 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  33.18 
 
 
446 aa  82.4  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  29.74 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  25.51 
 
 
586 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  28.33 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  27.17 
 
 
829 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.04 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  25.54 
 
 
742 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  28.04 
 
 
952 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  25.81 
 
 
826 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  28.03 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.9 
 
 
616 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  27.62 
 
 
1911 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  30.14 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  28.38 
 
 
586 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 
925 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  29.96 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  29.63 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  27.83 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  27.23 
 
 
668 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 
570 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.56 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  28.37 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  28.9 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  25 
 
 
636 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  24.61 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  28.44 
 
 
654 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  29.91 
 
 
781 aa  75.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  29.07 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  29.21 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  27.19 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.96 
 
 
657 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  28.95 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  36.43 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  27.4 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  26.75 
 
 
740 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  27.63 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.03 
 
 
820 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  25.38 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  29.56 
 
 
929 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  28.5 
 
 
862 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  27.91 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  27.91 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  29.17 
 
 
922 aa  72.8  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  26.38 
 
 
584 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  25.84 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  30.96 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.49 
 
 
654 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  27.83 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  33.12 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  25.79 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  34.11 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
623 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
625 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  36.59 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  25.21 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  34.48 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
637 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  25.86 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  26.1 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  29.03 
 
 
603 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  28.12 
 
 
527 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>