More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05513 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  95.62 
 
 
320 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05513  Sulfatase modifying factor 1 precursor-like protein (C-alpha-formyglycine-generating enzyme 1)  100 
 
 
320 aa  671    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  82.24 
 
 
319 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  90.57 
 
 
282 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  31.62 
 
 
330 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  28.7 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1793  hypothetical protein  28.24 
 
 
354 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  27.99 
 
 
325 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
398 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 
267 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  30.49 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.74 
 
 
325 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  31.22 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  26.69 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  28.68 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  28.24 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  26.18 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.65 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  27.4 
 
 
952 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
715 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  25.2 
 
 
586 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  24.56 
 
 
517 aa  82.8  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  27.95 
 
 
586 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.66 
 
 
616 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.13 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  26.77 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
1818 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  24.66 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.26 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.28 
 
 
614 aa  79.7  0.00000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  26.33 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  27.23 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.14 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  28.44 
 
 
654 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.61 
 
 
570 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  26.83 
 
 
751 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.57 
 
 
517 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  28.4 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  25.81 
 
 
826 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.72 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.96 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  29.68 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25.7 
 
 
829 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  26.34 
 
 
668 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  27.27 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.03 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  24.82 
 
 
742 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  23.85 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  29.67 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  30.82 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  26.43 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  27.84 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.85 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  28.79 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  26.22 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  26.24 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  29.05 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  29.23 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  28.37 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  25.62 
 
 
1911 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  27.19 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  25.91 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  26.44 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.45 
 
 
925 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  26.52 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  26.98 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  34.11 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  27.4 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  23.42 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  26.52 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  25 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  29.17 
 
 
922 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  26.53 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.11 
 
 
820 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  24.19 
 
 
636 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.12 
 
 
781 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  26.82 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  36.15 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  31.79 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  27.13 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  26.34 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 
1064 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  27.13 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  25.94 
 
 
538 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  34.43 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  34.69 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
611 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  32.56 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.33 
 
 
1023 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.48 
 
 
1581 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  27.18 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  25.6 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.27 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
637 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>