204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0987 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0987  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 381 aa  769    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  26.1 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.13 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  26.42 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.92 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  32.43 
 
 		 779 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.54 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  27.36 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.65 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.56 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  22.77 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  22.46 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.83 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  21.73 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.77 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  21.73 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.38 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  27.24 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.84 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  23.26 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  25.72 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  25.55 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  25.4 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.27 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  23.98 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.27 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.37 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  21.01 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2012  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  32.2 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0678  glycosyl transferase family 9  24.84 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  26.2 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.24 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  24.44 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.75 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  26.06 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.82 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5654  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  33.06 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2351  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.06 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  31.48 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  24.66 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  21.75 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2512  glycosyl transferase family 9  29.79 
 
 		 335 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.122114  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.95 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.69 
 
 		 346 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.06 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.06 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.06 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.39 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.68 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2335  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499927 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  25.24 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.37 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.91 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1507  heptosyltransferase family protein, putative  23.18 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.23 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.17 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.46 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2195  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2578  glycosyl transferase family 9  28.47 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  26.69 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.94 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0561  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  27.4 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.95 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2231  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  25.23 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.84 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.36 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  47.54 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1700  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2312  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.59 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25.57 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  30.77 
 
 		 574 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0976  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 315 aa  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  20.42 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>