79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0345 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 119 aa  246  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  50 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  40.18 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  37.96 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  47.44 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  44.58 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  47.44 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  44.87 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  46.15 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  37.61 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  44.87 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  44.87 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  36.13 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  44.16 
 
 		 192 aa  70.5  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  45.57 
 
 		 417 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  43.24 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  40.22 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  38.82 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  42.25 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  36.96 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  33.9 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  37.08 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  35.16 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  34.19 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.71 
 
 		 749 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  34.29 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  37.04 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  31.45 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  32.93 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  32.29 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.32 
 
 		 444 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  37.68 
 
 		 239 aa  50.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  27.1 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.06 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.06 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 623 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  32.74 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  32.53 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 		 358 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  35.06 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  30.11 
 
 		 336 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.85 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  36.36 
 
 		 347 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  32.35 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  32.93 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  32.39 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  36.23 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  36.71 
 
 		 280 aa  44.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  29.41 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  32.41 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  33.6 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  32.41 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  36.78 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  27.03 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  27.13 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  32.91 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  36.36 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  28.12 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  32.47 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  30.95 
 
 		 126 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  31.76 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  32.41 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  32.05 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  30 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  27.66 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  33.77 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  26.9 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  36.49 
 
 		 287 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1673  blue (type1) copper domain-containing protein  29.47 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  35.9 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>