58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2723 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  226  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  226  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  98.13 
 
 
108 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  69.75 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  69.75 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  69.75 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  75.24 
 
 
110 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  75.24 
 
 
110 aa  157  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  75.24 
 
 
110 aa  157  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  75.24 
 
 
110 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  51.46 
 
 
109 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  50.59 
 
 
109 aa  90.5  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  40.91 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  42.45 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  36.27 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  33.98 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0369  hypothetical protein  47.62 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  33.65 
 
 
122 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  34.41 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  35.58 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  34.74 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  37.04 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  35.14 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  35.14 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  35.14 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  35.14 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  35.14 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  31.63 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  34.91 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  32.73 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  34.12 
 
 
98 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  34.94 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  31.87 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  29.59 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  32.38 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  32.91 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  34.12 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  27.93 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  32.41 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  27.27 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  29.11 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  29.11 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  29.11 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  29.11 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1632  hypothetical protein  29.11 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0700074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1594  hypothetical protein  25.6 
 
 
129 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.607033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3751  hypothetical protein  25.66 
 
 
129 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.563383  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>