182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0062 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0577  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0550  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  51.02 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  28.43 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 270 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  30.77 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  35.94 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  34.88 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  29.87 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  29.47 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  29.9 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  29.13 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.99 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  29.35 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 341 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>