More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0467 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0467  major facilitator transporter  100 
 
 		 359 aa  694    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0594986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.83 
 
 		 476 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 472 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.63 
 
 		 432 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 432 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 433 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 432 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.36 
 
 		 472 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  26.12 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  31.37 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  30.43 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.48 
 
 		 455 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 477 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 473 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 474 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 474 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 399 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.49 
 
 		 459 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  26.96 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  26.96 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.03 
 
 		 455 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 451 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 474 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  32.99 
 
 		 467 aa  89.4  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  33.15 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  33.15 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  33.15 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  32.79 
 
 		 496 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  33.15 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  28.93 
 
 		 510 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.16 
 
 		 478 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  34.64 
 
 		 476 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 478 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 478 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 473 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 478 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.04 
 
 		 478 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  32.47 
 
 		 477 aa  86.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 478 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  28.43 
 
 		 510 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  28.43 
 
 		 510 aa  85.9  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  32.6 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  32.6 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  32.6 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  32.45 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.94 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  24.84 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  28.46 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.29 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>