More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2248 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  74.7 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  50.66 
 
 
260 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  53.51 
 
 
251 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  52.65 
 
 
269 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  51.63 
 
 
258 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4055  hypothetical protein  51.24 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  38.62 
 
 
2798 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  34.6 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  35.92 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  35.68 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  35.92 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  35.51 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  35.51 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  35.51 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  35.51 
 
 
266 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  35.1 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  35.1 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  32.44 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  31.34 
 
 
286 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  31.67 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  31.36 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  30.85 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  31.4 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  29.48 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  32.68 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.28 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  29.96 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  29.95 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.05 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  40.17 
 
 
121 aa  72  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  41.03 
 
 
121 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  30.05 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.92 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  30.24 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.47 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30.5 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.55 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  36.11 
 
 
117 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  35.8 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.32 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  31.17 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.05 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.91 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  32.89 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  35.85 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.23 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  32.64 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  28.23 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.23 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  37.23 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  29.63 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  36.36 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  31.02 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  31.02 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  35.4 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.19 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.23 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  36.11 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  36.36 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  31.75 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  28.74 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.03 
 
 
298 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  35.09 
 
 
123 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.34 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  25.91 
 
 
317 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.42 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  29.93 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  32.37 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  30.3 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  32.5 
 
 
123 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  33.61 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.23 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  29.44 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 
302 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  30.56 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  24.27 
 
 
265 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  28.97 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  41.74 
 
 
119 aa  62  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.43 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  27.06 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  30.18 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  34.65 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  30.18 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  33.33 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  29.02 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  35.71 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.84 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>