More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0369 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
501 aa  1018    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.44 
 
 
510 aa  415  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.99 
 
 
459 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.38 
 
 
349 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 
328 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 
350 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.45 
 
 
724 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.04 
 
 
337 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 
346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
322 aa  209  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.54 
 
 
344 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  36.54 
 
 
346 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
346 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
342 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.65 
 
 
347 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
349 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
346 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
353 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
347 aa  196  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  40.32 
 
 
353 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
338 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
350 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
342 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
368 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
352 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.51 
 
 
336 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
342 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
351 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
351 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.42 
 
 
340 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
312 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
351 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
353 aa  186  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
342 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.6 
 
 
342 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
342 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
312 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
312 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  41.35 
 
 
326 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 
342 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.26 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
325 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  33.23 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
315 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  32.91 
 
 
313 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
312 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
310 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
310 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.37 
 
 
325 aa  160  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
310 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
348 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
309 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
314 aa  143  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  31.58 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
305 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
313 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
312 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
329 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
310 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
311 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
310 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
310 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.32 
 
 
316 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.62 
 
 
319 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
356 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
312 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.77 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
321 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
333 aa  115  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
295 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.55 
 
 
344 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.55 
 
 
345 aa  113  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
328 aa  113  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
316 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
309 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
368 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
315 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.26 
 
 
324 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.45 
 
 
298 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
322 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
304 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>