More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1712 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  278  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  89.55 
 
 		 140 aa  247  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  89.55 
 
 		 140 aa  247  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  73.73 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  70.25 
 
 		 121 aa  180  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 121 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  66.67 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  66.67 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  65.83 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  65.83 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  64.17 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  64.17 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  62.5 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  61.67 
 
 		 121 aa  164  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  56.67 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  61.48 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  45.08 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  44.44 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  42.98 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.98 
 
 		 711 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2008  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 404 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 236 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  40 
 
 		 131 aa  84.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.4 
 
 		 1131 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 767 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.39 
 
 		 1992 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  37.84 
 
 		 414 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 233 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.04 
 
 		 1987 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  37.39 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.45 
 
 		 318 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.79 
 
 		 2284 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  39.64 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.78 
 
 		 2336 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.8 
 
 		 718 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1646 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  37.61 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1647 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  39.64 
 
 		 462 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1646 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  39.52 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1383  response regulator  37.93 
 
 		 409 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.65 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 566 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  37.93 
 
 		 2301 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 574 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 387 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  40.34 
 
 		 381 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 363 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 407 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  36.84 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  36.52 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  36.52 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  36.52 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  36.52 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>