80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3652 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  882    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  70.95 
 
 		 446 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  65.01 
 
 		 441 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  69.14 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  55.24 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.1 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  38.71 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.94 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  34.73 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  37.56 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  30.97 
 
 		 466 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  36.9 
 
 		 478 aa  192  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  29.41 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  29.19 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.93 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  26.79 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  23.52 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  25.45 
 
 		 457 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 414 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  28.82 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  29.53 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 421 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  28.57 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.52 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  26.01 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  26.49 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  25.66 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  30.47 
 
 		 465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  27.29 
 
 		 624 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  26.46 
 
 		 483 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  23.86 
 
 		 600 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  31.95 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.05 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  24.78 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.22 
 
 		 764 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  24.25 
 
 		 672 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.86 
 
 		 606 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  25.62 
 
 		 797 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.89 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  23.53 
 
 		 764 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  22.2 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  22.59 
 
 		 763 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  23.4 
 
 		 748 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  24.41 
 
 		 761 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.68 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.36 
 
 		 582 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  24.08 
 
 		 599 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  28.25 
 
 		 680 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  28.49 
 
 		 549 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.24 
 
 		 722 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  40.96 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.43 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  24.09 
 
 		 530 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  24.82 
 
 		 552 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.34 
 
 		 595 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  33.33 
 
 		 627 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  31.25 
 
 		 512 aa  43.1  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>