More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3537 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  100 
 
 		 364 aa  695    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  37.12 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 309 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.3 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.66 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.19 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  30.85 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.33 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.77 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.33 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.17 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  29.71 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  30.3 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.51 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.26 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  28.27 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.23 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  33.11 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  30.3 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  32.21 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.7 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  29.93 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.13 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  21.95 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.37 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.94 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.71 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  26.71 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.96 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.59 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>