More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3169 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.22 
 
 		 229 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 242 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 242 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 242 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  49.09 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.67 
 
 		 223 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 223 aa  208  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 221 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 236 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 230 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  50.68 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 224 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  50.23 
 
 		 223 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  48.44 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 223 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 231 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  47.95 
 
 		 223 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  44.09 
 
 		 226 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 220 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 220 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.49 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3981  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  43.89 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.14 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.14 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.14 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 224 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 223 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1322  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4138  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.55 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 226 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  43.81 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  46.58 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3523  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  42.47 
 
 		 218 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  44.09 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  44.09 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  44.09 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  44.09 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  44.09 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  44.29 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  43.84 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.74 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.74 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.74 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.74 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.74 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>