More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1190 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
227 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 
247 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 
229 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 
250 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 
247 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 
247 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 
247 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 
266 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  53.42 
 
 
291 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
282 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.05 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
282 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
242 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
242 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
273 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
252 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
242 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.34 
 
 
223 aa  224  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 
253 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 
223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 
224 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.95 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 
224 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 
224 aa  218  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 
224 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 
224 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.18 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.22 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
224 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.46 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  53.6 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 
266 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
223 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.79 
 
 
218 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  46.88 
 
 
223 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  46.88 
 
 
223 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 
221 aa  184  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  47.03 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 
224 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 
220 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 
225 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 
239 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 
220 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
223 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 
221 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 
225 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  42.92 
 
 
226 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  48.15 
 
 
221 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 
225 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 
223 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 
220 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 
224 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 
224 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
231 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 
220 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 
222 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 
223 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 
223 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  50 
 
 
220 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  44.39 
 
 
223 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  50 
 
 
220 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  50 
 
 
220 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  50 
 
 
220 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
230 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  50 
 
 
220 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>