264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0325 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  45.54 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  39.73 
 
 
233 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  41.21 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  41.85 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.5 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.4 
 
 
231 aa  125  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  41.24 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  36.73 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  39.04 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  38.83 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  35.58 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  39.08 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  39.66 
 
 
230 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  34.45 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  43.71 
 
 
229 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  39.33 
 
 
233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  29.95 
 
 
229 aa  111  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.12 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  39.23 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  35.59 
 
 
259 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 
235 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  32.16 
 
 
231 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  37.17 
 
 
237 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  37.17 
 
 
237 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
227 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 
244 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
261 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  37.57 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  43.51 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  38.51 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  39.47 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 
282 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  31.75 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  35.43 
 
 
389 aa  95.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  40 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 
231 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  37.91 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  42.64 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.71 
 
 
222 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  41.72 
 
 
235 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
269 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.65 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  35.75 
 
 
267 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.36 
 
 
228 aa  92  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  35.68 
 
 
239 aa  91.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 
261 aa  91.7  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 
239 aa  91.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  30.91 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  32.69 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  35.26 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.71 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  42.34 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  32.57 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  32.06 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36.41 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  38.41 
 
 
260 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  38.51 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  34.25 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
251 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  34.24 
 
 
236 aa  88.6  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  38.04 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  32.45 
 
 
230 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 
237 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  37.32 
 
 
232 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  33.72 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 
254 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.33 
 
 
254 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  38.73 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
236 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 
243 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  37.06 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  34.57 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  39.16 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  38.73 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.16 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  37.58 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  40.46 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>