More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6527 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  100 
 
 
246 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  80.58 
 
 
243 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  44.21 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  44.67 
 
 
244 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  48.72 
 
 
234 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.68 
 
 
235 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  45.19 
 
 
243 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  41.63 
 
 
241 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  43.35 
 
 
273 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  46.41 
 
 
241 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  39.91 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  36.59 
 
 
245 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  35.32 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  35.74 
 
 
231 aa  148  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  37.82 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  36.97 
 
 
231 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  34.89 
 
 
229 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  39.83 
 
 
237 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  41.84 
 
 
239 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  33.61 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  36.97 
 
 
241 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  35.98 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  35.32 
 
 
225 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  34.58 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  35.96 
 
 
223 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  31.95 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  35.09 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  35.09 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
237 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  32.62 
 
 
222 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  35.92 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  34.29 
 
 
241 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  35.32 
 
 
247 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  34.8 
 
 
248 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
242 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  31.08 
 
 
245 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  33.47 
 
 
247 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  28.75 
 
 
235 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
235 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.4 
 
 
238 aa  95.5  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  29.89 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  29.84 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 
248 aa  85.1  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  30.57 
 
 
195 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  29.34 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  29.46 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  29.46 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  37.86 
 
 
120 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  31.47 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  35.56 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  35.56 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  35.56 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  35.56 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  35.56 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  35.56 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  35.56 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  39.85 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  36.57 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  35.94 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  35.94 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  29.55 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  29.53 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
311 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  28.35 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  26.5 
 
 
242 aa  62  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
294 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
294 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  35.94 
 
 
294 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.19 
 
 
2762 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  25.91 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  40.95 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  30.69 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  31.19 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
346 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  41.44 
 
 
3045 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  37.35 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
336 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.78 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  27.59 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  32.28 
 
 
275 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  23.76 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
289 aa  52.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 
334 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.04 
 
 
293 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  31.25 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>