More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2180 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 339 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  80.48 
 
 		 341 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  72.81 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  72.81 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.64 
 
 		 351 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.3 
 
 		 334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.12 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.25 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.63 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  57.44 
 
 		 342 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  56.38 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.38 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.23 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.57 
 
 		 341 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.36 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.19 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  55.91 
 
 		 343 aa  348  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.65 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.93 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.4 
 
 		 339 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.49 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  53.66 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.35 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.83 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  53.35 
 
 		 339 aa  331  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  53.47 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  50.32 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.14 
 
 		 308 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.33 
 
 		 335 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.68 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.21 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.68 
 
 		 338 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.26 
 
 		 337 aa  256  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.04 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.4 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.67 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  52.69 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.23 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.61 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.64 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.59 
 
 		 511 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.25 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.76 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.9 
 
 		 365 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.18 
 
 		 511 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  40.97 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.01 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  37.04 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  43.46 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.14 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.6 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  38.19 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.13 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  36.12 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  36.22 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.98 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  35.52 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  36.71 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  37.06 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.74 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  37.37 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  36.65 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  35.52 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.74 
 
 		 363 aa  159  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.44 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  36.01 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  37.37 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 		 517 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  33.92 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  35.94 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  34.73 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  35.07 
 
 		 337 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  35.17 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  35.86 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  37.42 
 
 		 357 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  33.55 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  33.55 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  33.55 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  33.55 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  33.55 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  39.43 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.55 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  37.6 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  34.83 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  33.88 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  37.5 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  33.55 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  33.22 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  33.03 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.85 
 
 		 490 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  33.55 
 
 		 341 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>