More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1454 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  79.15 
 
 		 281 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  78.01 
 
 		 284 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  77.66 
 
 		 284 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  76.6 
 
 		 284 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  71.43 
 
 		 290 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  65.48 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  64.75 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  58.36 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  58.36 
 
 		 336 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  60.85 
 
 		 296 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  59.64 
 
 		 296 aa  351  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  58.93 
 
 		 296 aa  351  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  56.58 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.14 
 
 		 639 aa  348  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  57.65 
 
 		 334 aa  348  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  57.65 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 293 aa  339  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  57.45 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  56.94 
 
 		 293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  51.77 
 
 		 329 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  53.43 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  54.09 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  55.36 
 
 		 294 aa  308  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  49.35 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  53.5 
 
 		 289 aa  301  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  51.97 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  54.26 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 374 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  50.91 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  48.39 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  46.88 
 
 		 323 aa  288  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  48.39 
 
 		 301 aa  285  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  48.56 
 
 		 300 aa  285  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  53.19 
 
 		 296 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  47 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  48.03 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.06 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  46.13 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  48.76 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  48.58 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  48.94 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  45.13 
 
 		 323 aa  254  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  48.4 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  46.5 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.43 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  39.53 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  38.65 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  40.64 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  39.15 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  46.21 
 
 		 409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  60.87 
 
 		 99 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  54.29 
 
 		 80 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  43.48 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  38.66 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  28.92 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  37.14 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  28.28 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  38.84 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  30.95 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  36.67 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  35.9 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  35.9 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  34.72 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  35.9 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  26.71 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  31.25 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>