More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4449 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4449  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 521 aa  1062    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.03 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 478 aa  113  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  22 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 473 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.28 
 
 		 472 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  21.52 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.39 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.68 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  23.99 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  21.73 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  22.25 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  22.67 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  22.73 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.82 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0910  GntR family transcriptional regulator  20.84 
 
 		 474 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 532 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  21.92 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  22.91 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.28 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  23.9 
 
 		 493 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 483 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 470 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.12 
 
 		 483 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  24.16 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1831  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 482 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000881  transcriptional regulator  23.9 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.458944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  24.15 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 468 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 477 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3393  putative aminotransferase  20.28 
 
 		 500 aa  97.8  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 469 aa  97.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  24.15 
 
 		 468 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.15 
 
 		 468 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  24.15 
 
 		 468 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 472 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  24.15 
 
 		 468 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  21.57 
 
 		 474 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  21.66 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  21.41 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  19.79 
 
 		 475 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2910  regulatory protein, GntR  24.95 
 
 		 468 aa  94  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.779971  normal  0.0177788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3154  GntR family transcriptional regulator  21.73 
 
 		 469 aa  93.6  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 473 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 470 aa  93.6  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  23.11 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  23.11 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  23.11 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  22.91 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  22.91 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0247  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 482 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  21.99 
 
 		 474 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.39 
 
 		 472 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  22.38 
 
 		 474 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.76 
 
 		 487 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2335  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.33 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.179489  normal  0.948278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  21.93 
 
 		 496 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3037  transcriptional regulator, putative  25.49 
 
 		 468 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00850156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 470 aa  90.9  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  21.6 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  21.54 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 473 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 496 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2911  GntR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 471 aa  90.1  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 496 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  20.84 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  21.15 
 
 		 477 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  22.65 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 474 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  20.33 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>