89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4430 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  100 
 
 
350 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  36.83 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  38.04 
 
 
371 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  36.13 
 
 
344 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  37.96 
 
 
401 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  38.12 
 
 
351 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  34.97 
 
 
403 aa  225  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.56 
 
 
374 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  34.76 
 
 
380 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.47 
 
 
362 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.78 
 
 
362 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  35.56 
 
 
362 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.78 
 
 
362 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 
366 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  34.36 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.87 
 
 
369 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  35.67 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  35.63 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  36.5 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.86 
 
 
362 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  34.86 
 
 
362 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.86 
 
 
362 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  34.86 
 
 
362 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  34.57 
 
 
362 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.56 
 
 
362 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.15 
 
 
354 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 
362 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  33.64 
 
 
366 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 
366 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  35.17 
 
 
366 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
366 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
366 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
366 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  33.75 
 
 
348 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  34.47 
 
 
365 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 
358 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  33.75 
 
 
354 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 
363 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 
377 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  33.81 
 
 
370 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 
362 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  33.13 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  32.4 
 
 
368 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 
368 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 
362 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 
364 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  36.79 
 
 
333 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  32.59 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  33.65 
 
 
303 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  29.8 
 
 
155 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  25 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2862  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6418  normal  0.0284463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  24.89 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  24.89 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  37.23 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
361 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  25.55 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  21.55 
 
 
338 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.19 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5632  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0464998  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.83 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.83 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  20.13 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.83 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
366 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>