127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0268 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0268  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
103 aa  206  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  36.78 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  31.63 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  34.18 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  34.18 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
110 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.89 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.89 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  32.91 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.76 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.51 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  32.61 
 
 
110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.89 
 
 
113 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.72 
 
 
111 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  32.61 
 
 
110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  32.61 
 
 
110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  32.95 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  42.19 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  32.89 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.65 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.61 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2673  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.04 
 
 
110 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.94 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.63 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.65 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.74 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  31.87 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.74 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  29.07 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  29.07 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.17 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  32.43 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.62 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  35.24 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  27.38 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
104 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.18 
 
 
110 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
104 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 
99 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 
104 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.78 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.77 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
104 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
104 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.81 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
104 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.19 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.77 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.94 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1485  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.1 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  29.59 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.17 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.07 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  26.8 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  28.17 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.59 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  28.17 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  27.78 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0171  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.25 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>