286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1807 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0094  amino acid permease-associated region  91.37 
 
 		 417 aa  694    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.699923  hitchhiker  0.000401334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1109  amino acid permease-associated region  94.5 
 
 		 418 aa  736    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.632191  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1807  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 418 aa  810    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 435 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  25.63 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  25.63 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  25.63 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  21.87 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  22.11 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  21.87 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  25.67 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  23.24 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  21.87 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  26.35 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  22.04 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  22.36 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1006  lysine/cadaverine antiporter  28.31 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000705878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  24.21 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  23.06 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  24.78 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  25.07 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  22.34 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  20.57 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  22.37 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  25.08 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  22.03 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  25 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  24.55 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  24.65 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  19.56 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  19.56 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  19.56 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  25 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  23.81 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  23.81 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  22.47 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  23.81 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  23.81 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  23.81 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  27.14 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  27.14 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  27.14 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  27.14 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  27.14 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  22.65 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  20.53 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  20.94 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  22.43 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  22.43 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  22.37 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  22.37 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  22.43 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  22.37 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  22.69 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  22.37 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  31.35 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.38 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  23.64 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  23.64 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  24.87 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  23.64 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  23.64 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  31.35 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  25.28 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  24.72 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  24.48 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  24.06 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  23.95 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  23.76 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  24.72 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  24.72 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  20.16 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  24.72 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  24.72 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  24.32 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  20.63 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  23.95 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  20.63 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  19.49 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  20.71 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  22.9 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  21.08 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  23.62 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  26.36 
 
 		 463 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  26.36 
 
 		 463 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  26.36 
 
 		 463 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  24.94 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>