65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1481 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  91.14 
 
 		 371 aa  661    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 371 aa  735    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  90.28 
 
 		 371 aa  655    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  71.94 
 
 		 373 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  63.76 
 
 		 380 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  38.86 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  38.68 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 		 341 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  36.15 
 
 		 337 aa  210  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  34.73 
 
 		 343 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 		 343 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  34.84 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  35.46 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  32.73 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  29.02 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 435 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  27.52 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  23.68 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  22.49 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.75 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.33 
 
 		 328 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.87 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.65 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.32 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  25.25 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  28.97 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.55 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.89 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4885  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.06 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.29 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.28 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.03 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  26.76 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.2 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.46 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2292  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.46 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.64 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.475579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  28.89 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.71 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.58 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.58 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.46 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.09 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  22.46 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.64 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.62 
 
 		 322 aa  42.7  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 355 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>