44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1052 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  33.48 
 
 
251 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  34.96 
 
 
234 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  31.2 
 
 
234 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  32.03 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  33.03 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  30.67 
 
 
235 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  31.3 
 
 
257 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.58 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  28.51 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  27.31 
 
 
259 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  26.15 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  28.46 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  25.56 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  28.07 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  30.7 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  28.64 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  28.51 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  29.39 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  28.43 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  26.48 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  26.34 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  28.07 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.47 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  26.67 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.98 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.85 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  25.1 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.59 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.89 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  24.67 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  26.23 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.45 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.35 
 
 
658 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  22.88 
 
 
375 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  28.35 
 
 
475 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.29 
 
 
477 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  22.27 
 
 
639 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  26.11 
 
 
519 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  28.82 
 
 
499 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  20.67 
 
 
510 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  26.32 
 
 
492 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  25.15 
 
 
492 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>