77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1884 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  42.09 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  41.56 
 
 
321 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  40.33 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  39.87 
 
 
318 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  40.4 
 
 
317 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  34.47 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  41.81 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  36.66 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.32 
 
 
333 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  37.78 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  38.26 
 
 
326 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  39.54 
 
 
341 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  39.54 
 
 
341 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  33.02 
 
 
323 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  35.78 
 
 
355 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  35.35 
 
 
344 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  34.74 
 
 
323 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  36.3 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  36.3 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  35.47 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  30.34 
 
 
337 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  32.06 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  33.22 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  36.24 
 
 
318 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  34.34 
 
 
342 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  38.44 
 
 
372 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  33.44 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  32.7 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  35.91 
 
 
346 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  38.54 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  34.33 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  35.56 
 
 
339 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  34.92 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  33 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  30.32 
 
 
372 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  32.15 
 
 
337 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  33.55 
 
 
357 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  33.55 
 
 
357 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  29.97 
 
 
417 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  35.67 
 
 
330 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  35.81 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  32.23 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  34.23 
 
 
352 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  33.56 
 
 
315 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  31.76 
 
 
346 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  28.95 
 
 
316 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  27.05 
 
 
353 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  31.29 
 
 
362 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  33.76 
 
 
361 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  32.81 
 
 
365 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  32.3 
 
 
354 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  33.01 
 
 
365 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  32.81 
 
 
365 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  33.01 
 
 
365 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  32.81 
 
 
365 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  33.44 
 
 
361 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  29.18 
 
 
316 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  27.93 
 
 
353 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  33.12 
 
 
361 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  26 
 
 
374 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  28.34 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.17 
 
 
943 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  31.62 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.51 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  21.23 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.5 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.08 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  27.05 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  24.66 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  25.88 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.11 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.46 
 
 
428 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  23.82 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.13 
 
 
386 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>