More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1120 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  608  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  56.98 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  51.65 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  49.28 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  49.28 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  52.09 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  46.98 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  46.93 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  44.83 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  44.74 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  44.36 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  38.56 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  42.08 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  40.49 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  40.78 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  37.16 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  40.16 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  38.22 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  38.37 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  42.99 
 
 		 222 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  38.36 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.93 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  34.01 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  45.55 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  41.04 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.7 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 		 381 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  39.79 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  39.79 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  39.79 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.27 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 370 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  31.48 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  41.49 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  39.68 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.86 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.89 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  32.87 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.46 
 
 		 375 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  33.92 
 
 		 285 aa  138  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.41 
 
 		 363 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  38.14 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 370 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  36.73 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  34.52 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  38.17 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.38 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.06 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.41 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  39.67 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  36.04 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0010  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  38.42 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  30.9 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  44.76 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.15 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.41 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  31.41 
 
 		 357 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  44.29 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.91 
 
 		 361 aa  128  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  30.17 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  32.27 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  30.45 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  40.53 
 
 		 359 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  44.14 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  38.42 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  33.1 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  31.58 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.82 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  31.36 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  36.59 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  36.63 
 
 		 383 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.69 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  29.02 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  32.19 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  36.13 
 
 		 353 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 		 368 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  33.72 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.07 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  33.62 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  33.62 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  41.98 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  33.06 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>