More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2905 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  76.76 
 
 
477 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
468 aa  950    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  99.32 
 
 
443 aa  896    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  75.64 
 
 
471 aa  731    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
468 aa  950    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  60.04 
 
 
477 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  58.06 
 
 
459 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 
464 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  54.57 
 
 
464 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  56.01 
 
 
464 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  53.28 
 
 
473 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
480 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 
487 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 
457 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  38.19 
 
 
470 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
463 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  37.44 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 
486 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  39.83 
 
 
483 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
466 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
496 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
460 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 
473 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
466 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
474 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
462 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
454 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  33.66 
 
 
430 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
433 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
430 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 
425 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 
433 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 
430 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  31.7 
 
 
466 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.25 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  32.43 
 
 
430 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  31.26 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  32.43 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  32.18 
 
 
430 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
463 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
430 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
460 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
433 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
462 aa  160  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
456 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
456 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
430 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  30.72 
 
 
460 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
441 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
431 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
456 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  31.46 
 
 
440 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
460 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 
475 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
439 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
429 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  32 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.56 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
469 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
494 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
423 aa  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  29.78 
 
 
454 aa  153  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.64 
 
 
439 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.25 
 
 
424 aa  153  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
430 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
436 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.53 
 
 
426 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
426 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.53 
 
 
426 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
435 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.53 
 
 
426 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
449 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
456 aa  151  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
427 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.28 
 
 
426 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
463 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
465 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  150  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
486 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.5 
 
 
427 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
433 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
426 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.79 
 
 
426 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
428 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  31.1 
 
 
468 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>